"La Farfalla Nera" è incentrato su due tematiche fondamentali: il legame tra scrittura e atto magico e la scoperta di segreti relativi a forze ancestrali che da secoli manipolano e controllano l'umanità. Tra i protagonisti del romanzo ci sono due adolescenti che si amano ma le loro esistenze sono sconvolte da una serie di avvenimenti strani. Il ragazzo fa sogni indefinibili e sente che hanno a che fare con messaggi provenienti da altre dimensioni; la ragazza invece di colpo ha iniziato a percepire i pensieri delle persone che la circondano. Tutto sembra ruotare intorno a un misterioso individuo, chiamato il Sistematore, a conoscenza di molte cose e abituato a muoversi in vari ambienti, in logge e sette segrete, in dimensioni parallele e in realtà ancestrali.